Когда на Земле царила эпоха Средневековья, в этих краях, где ныне находится достопримечательность, существовал культ Богородицы, поэтому в то время с завидной частотой стали появляться святые места напрямую связанные с именем Девы Марии.
Церковь считают наиболее древней религиозной постройкой в Будве. С ней связана одна легенда. Считается, что проповедующие христианскую веру во всем мире монахи, прибывшие к берегу, поставили икону Девы Марии к крепостной стене и зажгли возле нее множество свечей.
Монахи начали призывать местных жителей, что привело к крепостной стене множество верующих христиан. Они решили воздвигнуть в этой связи на том месте церковь. Причем, на одном из каменных блоков осталась надпись, которую сделали монахи, а это в свою очередь не что иное, как документальное подтверждение времени возведения церкви Санта-Мария ин Пунта. Исходя из этой надписи, можно предположить, что постройка датируется 840 годом.
Уже из названия церкви можно понять, что она возведена на мысе (имеется в виду «пунта»). Сначала постройка была собственностью бенедиктинского ордена, а несколько позднее (15 век), перешла в руки францисканцев.
Во время наполеоновских войн церковь пережила весьма неприятные дни, из нее солдатами Франции была сделана конюшня. Тем не менее, кроме осквернения с ней ничего страшного не произошло, разрушение её не коснулось. Минуя несколько лет, церковная жизнь снова возродилась.
За всю историю существования церкви Санта-Мария ин Пунта, она не раз подвергалась перестройкам и реконструкционным работам.
В современности церковь функционирует как христианский собор. Внутри нее проводятся разнообразные музыкальные концерты и фестивали, все благодаря особенным акустически данным.
Находится примечательное место непосредственно в стене (крепостной) Старого города, примыкает к другой церкви – св. Саввы.