вы узнайте у авиакомпании как осуществляется перелет, как регистрируется багаж. и где вам поставят штампы в паспорте. я так думаю, что в берлине, так как формально шенгенскую зону вы пересечете именно там. поскольку рейсы внутри шенгена для них как бы местные, то вы с международного переходите на местный терминал, то есть должны пересечь границу. если бы летели нешенген-шенген-нешенген, то не покидали бы транзитной зоны и в город не пустили бы, соответственно.

состояние ваших финансов консульство не может проверить ни потом, ни сейчас, ни раньше. максимум, что банк может сказать, что есть такой счет на такую фамилию. говорить суммы они не имеют права.