У меня проблем не было. Стояла австрийская виза, прилетели в Мюнхен, далее на поезде в Иннсбрук. Пограничник спросил только цель визита в Австрию.
Такая же ситуация была у коллег, только им надо было в Голландию. Долетели до Кёльна и без вопросов дальше.