Вы путаете понятия... Электронный билет - это когда информация о пассажире хранится в электронной базе данных, а не на бланке. Вам выдается только маршрут-квитанция (но это информационный документ для вас или для отчета по командировке), но для регистрация она не нужна, для регистрации вам нужен только паспорт.
Электронные билеты сейчас и кассиры тоже оформляют, хотя по желанию пассажира могут и бумажный билет выписать, но за это почти все ак взимают сборы, потому что бланки денег стоят дополнительных.
Насчет того,как кассы деньги зарабатывают. АК платят кассирам деньги в зависимости от количества проданных авиабилетов, хотя все зависит от конкретного случая, конечно . С пассажиров обычно взимается агентсткий сбор, но он как правило составляет около 200 руб за один авиабилет в одну сторону, по-моему не такие огромные деньги)))