Мне в Томске в центре города две гостиницы понравились:
1. "Аврора" Адрес - Киевская, 11 (Гляди по 2гису), первый подъезд, администратора вызывать по домофону в квартире 4. А позвонить им можно по телефону 44-11-45 (код города Томска, кажется, 3822). Если там снимать 2-местный номер, то на двоих вот недавно в июне стоило у них 1300руб за номер, т.е. 650р с человека. А если одному проживать в комнате, то скорее всего будет стоить 1000-1100руб.
2. Гостиница "Спутник". Она чуть ближе к проспекту, но там сан.узлы на этаже. Зато завтрак включен. Номера эконом по 850руб (1-местные)
Вот ссылочка на их сайт.

Мне понравилось больше в Авроре - Завтрака там нет, но зато сан.узел в каждом номере есть (душ или ванна, умывальник и туалет). Микроволновка в коридоре стоит, можно пользоваться. Посуду тоже дадут, если надо. Окна пластиковые, тепло зимой, ну и телик есть.