Да задержка может быть по миллиону причин.
Представьте, что вы сидите во Внуково и ждете вылета в Калининград. Самолет на котором Вы должны улететь только за час до Вашего вылета прилетит откуда нибудь с Екатеринбурга. А в Ектеринбурге снегопад и аэропортовые службы не успевают во время обливать самолеты перед отправкой. Вот сдвинулось расписание. А т.к. расписание у Ская составлено так чтобы самолеты не простаивали на земле, то и получаются такие сдвиги.
Я летал с ними 8 раз за прошедшие полгода. 2 раза была задержка только. Не думаю что в S7 или Трансаэро ситуация намого лучше.