На вокзале Алма-аты 1 к приходу поезда из Новосибирска всегда подъезжает несколько маршруток до Бишкека (но нужно поторопиться, т.к. желающих много и может не хватить места в маршрутке, тогда вам предложат такси, но это дороже и опаснее - дорога идет через перевал). На маршрутке от вокзала в Алма-Ате до Дородоя в Бишкеке ехали от 1,5 до 3 часов в зависимости от убитости маршрутки, мастерства водителя и обстановке на дорогах.
По цене билета сейчас не помню, но что-то в районе 100 руб.