В ответ на: Давно так? Помнится 3 года назад с пересадкой 2 часа мне порекомендовали автобусом ехать.

Если честно не знаю как давно, но почти два года эту схему вижуХотя пользовался только этим летом.

В ответ на: ... покупая билеты не одновременно на внутренний и международный рейс, я могу считаться транзитным пассажиром (т.е. будут два билета отдельных)?

Тут я бы посоветовал в офис Аэрофлота обратиться.

У самого из Ш2 в Ш1 была пересадка в 5 часов, поехал на автобусе самостоятельно.
При этом как я понял в любом случае все получают багаж в Ш2 и дальше его регистрируют до например Нска.